В своей жалобе, которая была подана еще 26 января, адвокат настаивает на отмене постановления о наложении на Ходорковского взыскания, в рамках которого 24 января он был направлен в штрафной изолятор на пять суток.
3 апреля Читинский областной суд отменил решение городского суда Краснокаменска, ранее снявшего выговор Ходорковского. Таким образом, суд частично удовлетворил жалобу юристов колонии. Решение было принято в связи с имевшимся нарушением процессуальных норм.
Ходорковского поместили в ШИЗО за найденные во время обыска бумаги, которые, по мнению администрации, заключенным запрещено иметь при себе. Однако адвокаты утверждают, что бумаги Ходорковскому передал под роспись сотрудник колонии перед обыском. Еще одним основанием для помещения Ходорковского в штрафной изолятор стало взыскание в виде выговора "за оставление рабочего места", наложенное на него в середине декабря. В последствии этот выговор был аннулирован решением суда.
В мае 2005 года Мещанский суд Москвы признал Ходорковского и бывшего руководителя МФО "МЕНАТЕП" Платона Лебедева виновными в уклонении от уплаты налогов и мошенничестве в крупном размере и приговорил к девяти годам лишения свободы с отбыванием наказания в колонии общего режима. 22 сентября Мосгорсуд подтвердил приговор, снизив при этом срок наказания до 8 лет. С учетом уже прошедших двух лет заключения бывшим предпринимателям предстоит провести в колонии еще 6 лет. 15 октября Ходорковский был доставлен в исправительную колонию, которая находится в 550 километрах от Читы на окраине города Краснокаменск. 13 октября Лебедев прибыл в колонию №3 в поселке Харп Ямало-Ненецкого автономного округа.