Президент поручил Семену Вайнштоку максимально отдалить маршрут нефтепровода Восточная Сибирь - Тихий океан от Байкала. "Трасса должна пройти севернее той зоны, которая обозначена", - заявил Владимир Путин.
Против строительства нефтепровода около озера Байкал 20 марта выступили 73 депутата Государственной Думы. Письмо протеста было направлено президенту России. Подписали обращение к Владимиру Путину в основном члены КПРФ и "Родины", а также ряд независимых депутатов. В письме говорится, что Водный кодекс – это закон антинародный и антиконституционный и, по мнению депутатов, несет угрозу жизни и здоровью граждан России, а также безопасности государства. Водный кодекс был принят с большими нарушениями и, таким образом, фактически лишил Байкал водоохраной зоны.
Акции против строительства нефтепровода прошли во всех крупных городах России. В Иркутской области активисты политических организаций и граждане устраивали акции каждый день.
Экспертная комиссия государственной экологической экспертизы 24 января 2006 года дала отрицательное заключение проекту строительства нефтепровода, участок трассы которого будет проходить в 800 метрах от берега озера. Однако ОАО "Транснефть" через "Ростехнадзор" провело нужное для себя решение по этому проекту. Кроме того, в зоне озера Байкал случаются землетрясения до 10-11 баллов. В мировой практике нет опыта действующих нефтепроводов при такой высокой сейсмичности.