Из квартиры и офиса журналиста были изъяты модем и два компьютера. Обыск проводил следователь прокуратуры Абакана Дмитрий Ильченко совместно с несколькими оперативными работниками уголовного розыска. Затем из компьютеров Афанасьева были изъяты жесткие диски.
Напомним, в начале октября в отношении Михаила Афанасьева было возбуждено очередное уголовное дело по подозрению в клевете (ч. 2 ст. 129 УК России). За последние три года в отношении журналиста было возбуждено 10 уголовных дел. Сам Афанасьев считает все уголовные преследования незаконными и связывает их с деятельностью председателя Верховного суда Хакасии Сергея Потапенко.
8 сентября 2006 года в интернет-издании "Новый Фокус" Михаил Афанасьев опубликовал материал, в котором рассказал, как бывший старший помощник прокурора Хакасии, покалечив ребенка в ДТП, ушла от уголовной ответственности. Журналист подготовил текст на основе документов и свидетельств родственников пострадавшего мальчика. Позже выяснилось, что участником ДТП бывший прокурорский работник, а ныне мировой судья быть не могла. Виновником происшествия была женщина, прикрывшаяся известным именем.
Михаил Афанасьев принес извинения судье и ее мужу, опубликовал опровержение в своем издании и по телефону снова попросил прощения за допущенную ошибку. Однако 15 сентября заявление о привлечении к уголовной ответственности было подано в прокуратуру, и после проведения проверки возбуждено очередное уголовное дело, которое в настоящее время ведет следователь прокуратуры Абакана Дмитрий Ильченко. Журналисту избрана мера пресечения в виде подписки о невыезде.
"За несколько дней до проведения обыска я стал замечать за собой слежку. Также меня уведомили, что органы прокуратуры возобновили еще одно уголовное дело о публичном оскорблении сотрудника милиции, ранее лежавшее без движения. Ко мне стали приходить друзья, которым правоохранители рекомендуют давать показания против меня. Создается ощущение, что меня активно пытаются лишить свободы", - заявил "Агоре" Афанасьев.
В мае 2006 года обладатель премии имени Сахарова "За журналистику как поступок" Михаил Афанасьев был приговорен к условным срокам лишения свободы за клевету тремя обвинительными приговорами.