В декабре 2007 года Рудаков несколько недель провел в Самарском кардиоцентре. Спустя почти месяц, медкомиссия вдруг решила, что из-за гипертонического криза начальник горГАИ не может выполнять свои служебные обязанности. После этого по приказу начальника УВД Самары Алексея Щербакова, Рудаков поступил в подчинение начальника милиции общественной безопасности УВД Самары Дмитрия Сазонова для выполнения особых поручений. При этом вмешиваться в работу ГАИ Игорю Рудакову было строго запрещено.
Как сообщили в пресс-службе областного ГУВД, в ближайшие два месяца Рудаков должен определиться со своим дальнейшим трудоустройством. Экс-начальнику ГИБДД Самары на выбор предложили несколько руководящих должностей в органах ГАИ Нефтегорска, Тольятти и других городов области. Определиться надо до 23 марта, в противном случае Игорь Рудаков будет уволен.
Попытки уволить Игоря Рудакова, который продолжает семейную традицию, работая в органах милиции, начались еще осенью. Тогда руководство областного ГУВД совместно с областной прокуратурой инициировало масштабную проверку ГАИ Самары и издало приказ об отстранении Рудакова от должности. Однако в дальнейшем это решение было отменено на основании протеста городской прокуратуры. Игоря Рудакова поддержали самарские автолюбители, которые заявили о готовности провести в Самаре акции протеста против его увольнения вплоть до перекрытия дорожного движения.
Между тем, начальник ГАИ Самары хорошо известен пользователям местных ресурсов Интернет как первый милицейский руководитель, общающийся с пользователями всемирной паутины. Самарские автолюбители считают, что благодаря Игорю Рудакову удалось уменьшить коррупцию в городском ГАИ. Он инициировал установку на крупных перекрестках Самары камер Интернет-наблюдения, что позволило улучшить контроль за работой экипажей ГИБДД.